Seekor kelinci nakal, Peter Rabbit (James Corden) sering mencuri hasil kebun milik tetangganya, McGregor (Domnhnall Gleeson). Akibatnya McGregor sangat membenci Peter Rabbit dan berusaha mengusir para kelinci.Namun karena McGregor menyukai seorang pelukis, Bea (Rose Byrne) yang merupakan seorang penyayang binatang. McGregor berpura-pura menjadi teman kelinci sambil diam-diam mencari cara menyingkirkannya. Peter yang tak kenal takut pun berulah untuk mengagalkan rencana McGregor.